Анализ данных в офтальмологии

В ФГБНУ «НИИГБ им. М.М. Краснова» с 2024 года существует референсный центр по анализу данных в офтальмологии.

Коллектив центра осуществляет сбор данных офтальмологических исследований, их обработку, анонимизацию и создание датасетов для решения прикладных задач анализа данных в офтальмологии.

В данный момент собираются данные для решения следующих задач:

---

Тремя сотрудниками НИИГБ происходит сбор данных с приборов «Heidelberg Spectralis HRA+OCT» в формате E2E, с дальнейшей конвертацией в формат DICOM и PNG и их аннотированием, в процессе которого врачами на снимке отмечаются качественные признаки наличия или отсутствия следующих патологических элементов:

• Атрофия ретинального пигментного эпителия
• Друзы
• Изменения по типу отека
• Интраретинальные кисты
• Необходимость дополнительных снимков для составления заключения
• Отслойка нейроэпителия
• Отслойка ретинального пигментного эпителия

Формирование датасета возможно в виде CSV-таблицы с наличием описанных элементов, или в виде структуры папок, в названии которых указано присутствие ВМД и ее формы:

1. wet_yes
2. wet_no
3. dry_yes
4. dry_no

Скачать примеры датасетов ОКТ *

---

Собираются данные КТ-исследований слезных путей.

Данные сохраняются в виде DICOM-файлов с серией снимков головы человека до и после введения контрастного препарата в слезные пути.

Информация об исследовании сохраняется в файле DICOMDIR в структурированном виде и в виде серии DICOM-файлов в отдельной папке.

Ведутся поисковые исследования по анализу данных для выявления патологий слёзных путей по бесконтрастным снимкам.

Использование рентгеноконтрастного препарата – это сложная процедура, требующая навыков, оборудования и расходных материалов. Отказ от контрастирования позволит упростить исследование и сделать его доступнее для пациентов.

Кроме того, многие КТ проводятся без контраста по другим причинам, например, при травмах или заболеваниях пазух носа. Автоматический анализ таких снимков с помощью нашей системы поможет выявлять нарушения слёзоотведения на ранних стадиях.

Скачать пример исследования

---

Собираются данные с нормой и астигматизмом с прибора «Анализатор переднего отрезка глаза с функцией оптической биометрии Pentacam AXL WAVE, Oculus Optikgerate GmbH».

Данные сохраняются в виде результатов обследований в графическом и текстовом форматах.

Графический формат подразумевает отрисовку результатов исследований в виде изображения в JPG формате.

Текстовый формат — результаты исследований в виде CSV-таблицы. Осуществляется сбор данных в норме и при подозрении на кератоконус.

Решается задача детекции подозрения на кератоконус.

Применение в клинике — выявление пациентов с признаками кератоконуса во время рутинных обследований.

Скачать пример исследования

---

ФГБНУ «НИИГБ им. М.М. Краснова» приглашает к сотрудничеству разработчиков решений в области анализа данных в офтальмологии и искусственного интеллекта.

Для получения информации, напишите запрос на почту ml@niigb.ru

* — Формат датасетов может быть изменен по запросу