Научно-клинической и организационной основой отдела патологии сетчатки и зрительного нерва была организация службы терапевтических методов лечения офтальмологической патологии. Большой вклад в работу этого направления внесли Ильяс Абдуллович Мустаев и академик РАЕН, профессор Геннадий Серафимович Полунин. Стоит отметить, что Геннадий Серафимович являлся непосредственным основоположником терапевтической офтальмологии в ФГБНУ «НИИГБ им М.М. Краснова».
В 2015 г. отдел был реорганизован в отделение клинических исследований в офтальмологии, руководителем которого стала доктор медицинских наук Мария Викторовна Будзинская. Под ее руководством качественно изменился подход к решению многих вопросов терапевтического лечения в офтальмологии: использование новейших методов диагностики, внедрение антиангиогенной терапии с использованием моноклональных антител в лечении инволюционных заболеваний сетчатки, диабетического макулярного отека и многое другое.
В 2018 году была проведена реструктуризация, в результате отдел патологии сетчатки и зрительного нерва был расширен, появились новые научные направления. Сотрудники отдела стали принимать участие в международных клинических исследованиях: в 2019 году – 8 клинических исследований, в 2020 году – 7, в 2021 году – 14. Важно отметить, что институт был первым в России, кто с 2012 года принимал участие в международных мультицентровых исследованиях эффективности и безопасности применения моноклональных антител при различных заболеваниях сетчатки.
Основными направлениями работы отдела являются современные методы диагностики и лечения заболеваний сетчатки, таких как возрастная макулярная дегенерация, диабетическая ретинопатия, миопическая макулопатия, ретинальные венозные окклюзии, наследственные заболевания сетчатки и зрительного нерва, воспалительные заболевания зрительного нерва.
Особое внимание уделяется диагностике и лечению орфанных, генетически детерменированных заболеваний и ассоциированной с геронтологическими проблемами патологии. В отделении разработан дифференцированный алгоритм диагностики и лечения оптических нейропатий различного генеза.
Ведутся работы по выявлению диагностического и прогностического значения аллелей антигенов гистосовместимости в развитие увеитов.
Отдел является одним из центров, участвующих в проведении международных клинических исследований.