Научные исследования института соответствуют основным мировым тенденциям развития офтальмологической науки и проводятся по следующим основным направлениям:

• объективизация критериев диагностики и мониторинга глауком, повышение эффективности лечения глауком;
• экспериментально-клиническое обоснование применения трансплантационных материалов в офтальмологии;
• изучение анатомии, физиологии и патологии органа зрения на основе современных морфофункциональных методов исследования;
• хирургия хрусталика и интраокулярная коррекция в нестандартных условиях;
• разработка новых технологий селективной кератопластики;
• диагностика, профилактика и лечение инфекционных заболеваний глаз;
• диагностика и лечение (включая консервативные, лазерные и хирургические методы) поражений глаз при диабете;
• совершенствование диагностики и лечения инволюционных заболеваний сетчатки;
• оптимизация методов диагностики и коррекции первичных и индуцированных аметропий;
• операции по декомпрессии орбиты у пациентов с эндокринной офтальмопатией.